环评工程师通过率低的原因主要有以下几点：

1. 需求量减少 ：随着资质放开和简政放权，一个工程师可以独立开设公司进行环评工作，对工程师数量的需求减少。同时，许多项目可以免去环评，导致环评项目数量下降，进而减少了对环评工程师的需求。

2. 考试难度大 ：环评工程师考试涉及的知识面广泛，需要较长时间的复习准备。很多从业人员工作繁忙，复习时间有限，导致通过率不高。案例分析部分尤其难，主观性太强，题目复杂，答案众多，很容易导致考生失分。

3. 合格标准调整 ：考试部门会根据环保行业情况和报考情况调整合格标准，以确保行业的稳健发展。国家对注册环境评价工程师的总量有控制，每年的通过人数有限，一般在200人左右，使得通过率维持在较低水平。

4. 考生弃考或复习不足 ：部分考生可能因为各种原因弃考，或者没有充分准备考试，这也影响了通过率。

5. 实践经验要求 ：除了专业知识外，考生还需要具备一定的环境影响评价工作经验，并能独立完成评价工作。这对已经参加工作的考生来说是一个额外的挑战。

6. 报考条件限制 ：通常要求考生满足一定的工作年限，这对已经参加工作的考生来说是一个额外的挑战。

7. 市场供需不平衡 ：虽然国家急需环评人才，但由于通过率低，导致符合条件的工程师数量不足，市场供需不平衡。挂靠现象也挤占了实际从事环评工作的工程师数量，进一步减少了市场上可用的环评工程师。

8. 行业恶性竞争 ：一些小公司为了压缩成本，恶意压低环评报告的价格，导致行业整体利润下降，进而影响了环评工程师的收入和职业前景，部分工程师选择离开行业。

综上所述，环评工程师通过率低的原因是多方面的，包括市场需求减少、考试难度高、合格标准调整、考生弃考或复习不足、实践经验要求、报考条件限制、市场供需不平衡以及行业恶性竞争等。这些因素共同作用，导致了环评工程师的稀缺性。