1999年毕业证可以通过学历认证或联系毕业学校开具证明的方式查询。具体方法如下：

1. 学历认证

由于学信网主要查询2000年以后的毕业信息，1999年的毕业证无法直接在学信网上查询。可以通过学信网申请学历认证服务。认证过程中，需要提供相关个人信息（如姓名、身份证号、毕业学校等），并支付一定费用。认证成功后，可获得学历认证报告，证明毕业证的真实性。

2. 联系毕业学校

另一种方法是直接联系毕业学校，向学校申请开具学历证明。证明中应包含以下信息：姓名、身份证号、入学时间、毕业时间、专业名称及毕业证书编号等。这种方式适用于学校档案保存完整的情况。

3. 注意事项

• 学信网认证可能需要一定时间，请提前申请。
• 若毕业学校已更名或合并，可通过教育部门查询相关信息。
• 确保提供的信息准确无误，避免因信息不符导致查询失败。

通过以上方法，您可以顺利查询1999年的毕业证信息。如需进一步帮助，建议咨询学信网客服或毕业学校相关部门。