支付宝可以缴纳合作医疗，但需满足以下条件并注意地区差异：

一、可缴纳条件

1. 地区支持 ：需所在城市开通支付宝社保缴费功能，目前仅部分城市支持（如福建、上海等）。

2. 缴费类型 ：主要支持城乡居民医保缴费，部分城市可能合并社保与医保项目。

二、操作流程（以福建为例）

1. 入口选择

   打开支付宝→点击首页【市民中心】→选择【社保】→进入【福建社保缴费】。

2. 信息填写

   输入缴费人身份证号、姓名、缴费年限及金额，核对无误后提交。

3. 缴费确认

   确认缴费信息后完成支付，支付宝会生成缴费账单。

三、注意事项

1. 地区差异 ：不同城市操作路径可能不同，建议优先通过支付宝搜索“社保”或“市民中心”进入本地服务。

2. 缴费时效 ：需在规定时间内完成缴费，逾期可能影响报销。

3. 权威性参考 ：操作以支付宝官方指引及高权威性平台（如中企动力、搜狗律师）信息为准。

若所在城市未开通支付宝缴费功能，可通过线下社区、村委会或官网完成。