根据教育部《本科毕业论文（设计）抽检办法（试行）》规定，本科论文抽检不合格的处理方式如下：

一、处理流程与要求

1. 确认问题与修改

   首先需仔细阅读抽检结果，针对查重率过高、抄袭、格式规范等问题进行修改。可向导师或专业人士寻求指导，确保修改符合学术规范。

2. 重新提交与复查

   修改完成后，按学校要求重新提交论文，并接受复查。需确保查重率降至学校标准以下，且所有引用和格式规范。

3. 严重后果

   若存在抄袭、伪造等学术不端行为，学校将依法撤销学位证书，四年学业作废。连续两年抽检问题较多或专业，省级教育部门可能通报高校、减少招生计划，甚至撤销学士学位授权点。

二、申诉与补救措施

• 申诉流程 ：若认为抽检结果不公，可向学校提出申诉，提供修改记录、导师评价等证据，申请复议。

• 延长学制或考研 ：因论文问题无法毕业者，可申请延长学制或选择继续考研。

三、注意事项

• 遵守学术规范 ：避免抄袭、剽窃等行为，确保论文原创性和规范性。

• 提前准备 ：关注学校和教育部政策，了解抽检流程及时间节点，及时沟通修改方向。

以上信息综合自教育部官方文件及权威教育平台，具体操作以学校要求为准。