一本、二本和三本大学的学费差异主要体现在学校性质、学科设置和地域经济水平等方面。一本大学通常是重点高校，学费相对较低；二本大学多为普通本科院校，学费居中；三本大学多为独立学院或民办高校，学费较高。以下将从学校性质、学科设置、地域经济水平及资助政策等方面详细阐述。

1. 1.学校性质：一本大学：多为国家重点支持的高校，享受较多的财政拨款，学费相对较低。这些学校通常以培养高素质人才和进行高水平科研为目标，学费设置较为亲民，以减轻学生经济负担。二本大学：多为省属或市属高校，财政支持相对较少，学费较一本大学略高。这些学校注重应用型人才的培养，学费设置在中等水平。三本大学：多为独立学院或民办高校，主要依靠学费和社会资金运营，学费较高。这些学校通常提供更为灵活和多样化的教育服务，学费也因此较高。
2. 2.学科设置：一本大学：学科设置广泛，涵盖文、理、工、农、医等多个领域。由于其重点学科和科研项目较多，学费在不同学科间差异不大。二本大学：学科设置较为集中，主要以应用型学科为主。学费在不同学科间可能存在一定差异，但总体上保持中等水平。三本大学：学科设置灵活，通常根据市场需求调整专业设置。由于其市场化运作，学费在不同学科间可能存在较大差异，尤其是一些热门专业。
3. 3.地域经济水平：一本大学：主要分布在一线和省会城市，经济发展水平较高，政府财政支持力度大，学费相对较低。二本大学：分布在各省市的不同地区，经济发展水平不一，学费设置也因地而异，但总体上保持中等水平。三本大学：多分布在经济较发达地区，学费较高，部分原因是为了适应当地较高的生活成本和教育资源成本。
4. 4.资助政策：一本大学：由于学费较低，且学校和政府提供的奖学金、助学金较多，学生经济压力相对较小。二本大学：学费居中，学校和政府提供的资助政策也较为完善，学生可以通过多种途径获得经济支持。三本大学：学费较高，但学校通常提供较为灵活的资助政策，如分期付款、奖学金和助学金等，以帮助学生减轻经济负担。

总结来看，一本、二本和三本大学的学费差异主要源于学校性质、学科设置、地域经济水平及资助政策等因素。学生在选择大学时，应综合考虑自身经济状况、专业兴趣和未来发展方向，选择最适合自己的教育路径。各高校和政府也在不断完善资助政策，以帮助学生顺利完成学业。