毕业后智慧团建系统仍显示在高中团支部，通常是由于团组织关系未成功转接或系统延迟导致。以下是具体处理建议：

1. 核实团组织关系状态

   登录智慧团建系统，使用身份证后八位密码查询团组织关系是否仍在初中。若显示已转出，可能是系统延迟或高中端更新延迟，可尝试刷新页面或多次登录。

2. 联系高中团委处理

   若系统显示仍在高中团支部，需联系高中校团委说明情况。高中团支部会统一处理跨省转接问题，通常1-2个工作日内可更新信息。

3. 确认转接流程是否完成

   检查是否已通过初中团组织管理员审批转接至高中团支部，再由高中团支部转接至大学。若直接从初中转大学可能因信息不全被驳回，需按正规流程操作。

4. 关注系统更新提示

   部分情况下，系统需手动触发更新。若长时间未变化，可定期查看智慧团建平台或联系管理员确认处理进度。

注意事项 ：若因团费未缴纳导致系统异常，需及时补交团费以解除限制。若问题持续，建议向学校学生工作部门或上级团组织寻求帮助。