​​中华医学会主办的权威医学期刊包括《中华医学杂志》（创刊于1915年，中国最早被国外医学索引收录的中文版期刊）和《中华医学杂志英文版》（创刊于1887年，中国首个被SCI核心版收录的医学期刊），均以推动全球医学研究交流为核心目标。​​

中华医学会作为中国医学科研领域的核心学术组织，其主办的医学期刊在推动国内外医学研究交流中扮演重要角色。《中华医学杂志》作为综合性医学学术期刊，每周出版，涵盖基础医学、临床医学及前沿技术等内容，被19个国内外重要数据库收录，包括《中国科学引文数据库》及多个医学索引系统。该期刊的宗旨是通过高质量科研成果的传播，促进医学理论与实践结合，提升医学研究的国际影响力。《中华医学杂志英文版》则专注于对接全球医学研究，创刊历史可追溯至1887年，是中国首本被国际知名数据库如《科学引文索引》(SCI)和Medline收录的医学期刊。该期刊以推动中国医学科研成果走向国际为目标，内容涵盖医学各学科的新技术与进展，并与全球50多个国家建立期刊交换机制，扩大其国际学术影响力。
这两本期刊均采用严格的双盲同行评审机制，投稿范围面向全球，编辑团队由国内外知名专家组成，确保学术质量与学术公正性。与此两本期刊均依托中华医学会的平台优势，定期举办专题论坛与继续教育项目，进一步推动医学科研与临床实践的协同发展，成为连接中国与国际医学研究的重要桥梁。