巢湖的行政区域划分以​​“一湖跨三市”​​为核心特征，目前由​​合肥、芜湖、马鞍山​​三市共同管辖，其中合肥市代管县级巢湖市及庐江县，芜湖市辖无为市（原无为县），马鞍山市管辖含山县与和县。​​环巢湖十二镇​​构成休闲旅游核心区，湖岸线涉及合肥包河区、肥东、肥西、庐江及巢湖市五个县级区域，形成“二市三县环抱”的地理格局。

巢湖的行政区划历经多次调整，2011年地级巢湖市撤销后，原居巢区改为县级巢湖市，由合肥市代管，同时庐江县划归合肥，无为县划归芜湖，含山县、和县划归马鞍山。这一调整使巢湖成为全国少有的跨市级行政区的湖泊，流域管理涉及五市十五县（区），包括安庆岳西、六安舒城等。环巢湖国家旅游休闲区规划覆盖4000平方公里，整合了滨湖新区、巢湖市区及十二个特色镇，如中庙、黄麓、三河等，形成“一湖两城十二镇”的空间布局。

巢湖水域面积随水位波动显著，低水位时约560平方公里，高水位可达825平方公里，湖岸线最长181公里。沿湖35条河流中，杭埠河、南淝河等主要河流自西、北汇入，经裕溪河注入长江。流域内巢湖闸以上集水面积占70%，闸以下为灌溉与航运枢纽。巢湖市现辖6个街道、12个镇，包括半汤、中庙等街道及柘皋、烔炀等镇，陆地总面积2046平方公里，湖域占463平方公里。

环巢湖区域正以生态旅游与城乡融合为重点，打造国际研学、康养等四大城镇群。游客可通过环巢湖大道串联湿地、古镇等景点，体验“八百里巢湖”的生态与人文魅力。建议关注水位变化对湖区游览的影响，优先选择杭埠河、姥山岛等核心景观带。