初会成绩合格单和证书的区别主要体现在以下几个方面：

1. 发布机构与性质 ：

• 合格单 ：由财政部会计资格评价中心发布，证明考生成绩合格。合格单是办理初级会计考试合格证书的凭据与证明。

• 证书 ：由中华人民共和国人力资源和社会保障部与财政部批准颁发，具有法律效力。证书是最终的成绩证明，用于求职、加薪等场合。

2. 使用场合与时间 ：

• 合格单 ：在考试结束后，证书领取尚需一段时间，考生可以将成绩合格单打印下来，作为已经获得初级证书的证明。部分地区领取证书时也可能需要携带成绩合格单。

• 证书 ：领取证书后，合格单并不能等效使用。证书是最终有效的证明文件。

3. 法律效力 ：

• 合格单 ：虽然可以作为临时证明，但并非最终有效的法律文件。

• 证书 ：由人事部印制，具有法律效力，通常在成绩公布后2~3个月发布领取通知，考生按流程提交材料即可领取。

4. 领取流程 ：

• 合格单 ：考生可在成绩公布后约1个月自行下载打印合格单。

• 证书 ：需要考生在成绩发布之后，到当地财政局或人事局办理，提交相关材料领取。

综上所述，初会成绩合格单和证书在发布机构、性质、使用场合与时间、法律效力及领取流程等方面均存在明显区别。合格单主要用于临时证明和领取证书的凭据，而证书则是最终有效的法律文件。建议考生在考试结束后妥善保管合格单，并在规定时间内领取并妥善保管初级会计证书。