工程公司总工程师的工作内容主要包括以下几个方面：
- 项目工程建设的总体控制和管理 ：
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负责项目工程建设的总体控制、质量、进度、工程造价控制和技术管理等建设管理工作。
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编制项目建设的总体实施计划、年度和分月度的实施计划，并对实施中的项目计划进行统计分析和计划调整。
- 技术管理和协调 ：
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组织项目办、监理单位和施工单位全面分析工程的特点与实际情况，制定相应的针对性措施和重点控制流程。
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监督集中招标采购的大宗施工设备材料的质量和供应工作。
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协调工程技术方面合同各方及项目对外各方的工作关系。
- 设计和监理 ：
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主持设计、监理、施工单位进行设计图纸会审、技术交底、设计完善和优化等。
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负责新技术利用和项目的配套工程科研工作。
- 质量管理和监督 ：
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负责项目建设中的技术管理工作，监督施工合同履行，定期或不定期组织相关科室人员深入施工现场，督查施工单位三大负责人、专业工程师与主要机械设备的到位和工作情况。
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负责企业质量管理工作整体规划和全面推动，拟订企业年度质量工作计划与年终总结。
- 技术发展规划和技改 ：
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负责企业技术发展规划的编制工作，拟订企业年度技术工作计划与年终总结，推动企业技术进步。
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负责企业技改论证及实施工作，审定企业技改及重大技措中的技术方案。
- 人员管理和培训 ：
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负责技术队伍的管理和队伍培训工作。
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负责技术人员和工人的定级工作。
- 科研和知识产权 ：
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负责企业科研、科技成果和专利、技术推广、科技保密、科技情报、科技档案等工作。
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主持企业技术委员会工作，组织查验项目表编制工作。
- 外部技术交流和合作 ：
- 参与外部技术交流和合作，提升企业的技术水平和竞争力。
- 项目交工验收和总结 ：
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负责组织项目交工验收及项目交工总结报告、执行总结报告的编写，并签发合同段工程交工证书。
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负责项目缺陷责任期的工程缺陷修复管理。
- 其他职责 ：
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负责编制项目竣工文件，做好项目的竣工验收的相关工作。
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对主任负责，分管工程建设管理科，并对现场管理办公室工程管理方面的工作进行监督和业务管理。
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负责工程建设有关资料的收集和归类建档工作，负责审核工程建设统计资料，主持编写工程总体进展情况汇报，报送项目建设管理规定的信息和统计资料。
这些职责涵盖了从项目启动到竣工验收的整个过程，确保工程项目的顺利进行和高质量完成。总工程师在项目中扮演着技术领导和协调者的角色，对项目的成功至关重要。