根据搜索材料和相关信息，12123科三补考费的缴纳流程和费用如下：

缴费流程

1. 1.登录交管12123：打开手机中的交管12123应用程序，输入个人账号和密码登录
2. 2.寻找缴费入口：在主界面上找到并点击“考试费”选项，然后选择需要缴纳的科目三补考费
3. 3.确认付款信息：确认付款信息正确后，点击“确认付款”按钮
4. 4.完成支付：按照提示完成付款操作

补考费用

• 科目三补考费：40元。
• 其他费用：如果包含考试模拟费，费用会有所不同。例如，上海的科三模拟一圈费用为250元

其他注意事项

• 缴费方式：除了通过交管12123平台缴费外，还可以在驾校或车管所进行缴费
• 缴费时间：建议在考试前完成缴费，以免影响考试安排。
• 缴费凭证：缴费完成后，建议截图保留凭证，以便日后查验。

特殊情况

• 缴费失败：如果遇到缴费失败的情况，可以检查手机和网络状况，尝试退出软件并重启手机后再次操作，或者联系交管12123平台的客服

12123科三补考费为40元，具体缴费流程和注意事项如上所述。如果有其他疑问，可以拨打交管12123平台的客服电话进行咨询。