机械电子工程考研可以选择清华大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学等顶尖院校，这些学校在学科评估中表现优异，同时也有广东工业大学、西安理工大学等特色院校适合不同层次考生。

1. 顶尖院校推荐：清华大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、华中科技大学在机械电子工程领域长期稳居全国前列，学科实力强、科研资源丰富，适合成绩优异且追求学术深造的学生。

2. 985/211实力院校：北京理工大学、天津大学、浙江大学、西安交通大学等综合性强，机械电子工程专业排名靠前，兼顾学术与就业优势。

3. 行业特色院校：广东工业大学、西安理工大学、西南交通大学等院校在机械电子工程应用领域有独特优势，与企业合作紧密，适合注重实践与就业的考生。

4. 地方重点院校：如湖南工业大学、广西科技大学等，学科建设扎实且录取竞争相对较小，适合分数中等但希望获得优质教育的考生。

选择院校时需结合自身成绩、研究方向及地域偏好，建议提前了解目标院校的导师团队和实验室资源。