根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，驾驶证换证超过90天的处理方式如下：

一、正常换证情形

1. 过期未超过1年

   可正常办理期满换证业务，需提交身份证明、身体条件证明等材料。

2. 过期超过1年但未超过3年

   驾驶证进入“注销可恢复”状态，需参加 科目一 考试并完成恢复驾驶资格业务（仅限县级车管所办理）。

二、需参加科目一考试的情形

• 过期超过3年

  驾驶证作废，需重新参加 科目一 考试获取新证。

三、其他注意事项

1. 逾期超过3年的法律后果

   若驾驶证过期超过3年且未换证，将无法恢复驾驶资格，需重新考证。

2. 补证流程

   • 需携带身份证、原驾驶证、体检证明、驾驶证照片等材料；

   • 填写《机动车驾驶证申请表》并缴纳罚款及滞纳金（具体金额咨询当地车管所）。

3. 特殊情况处理

   • 若委托他人办理，需提交代理人身份证明及授权委托书；

   • 驾驶人信息变更需在30日内向核发地车管所备案。

建议及时通过“交管12123”APP或当地车管所办理换证，避免因逾期影响驾驶权益。