入党申请书是会放入个人档案的。

入党申请书作为党员档案中的重要材料，记录了个人的入党意愿和思想动态。以下是关于入党申请书在档案中的详细说明：

1. 入党申请书的作用：入党申请书是党组织了解申请人入党动机、思想觉悟和对党的认识的重要依据。它反映了申请人的政治态度和对党的忠诚度。

2. 入党申请书的提交：申请人在提交入党申请书后，党组织会对申请书进行审核，并决定是否将其纳入党员档案。通常情况下，只要申请书内容真实、态度端正，都会被存入档案。

3. 党员档案的内容：党员档案是记录党员个人信息、政治表现、工作经历等重要材料的集合。除了入党申请书，还包括入党志愿书、转正申请书、党组织关系证明等。

4. 档案的管理和使用：党员档案由党组织或相关部门进行管理，并在需要时提供查阅和使用。例如，在干部选拔任用、评优评先、组织关系转接等情况下，都可能需要查阅党员档案。

5. 档案的保密性：党员档案属于个人隐私，其内容和使用都受到严格保密。只有经过授权的人员才能查阅和使用档案，以保护党员的个人信息和权益。

总结：入党申请书作为党员档案中的重要材料，不仅记录了个人的入党意愿和思想动态，也是党组织了解和考察申请人的重要依据。入党申请书会被放入个人档案，并受到妥善管理和保密。