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根据团员档案的组成要求，档案袋中是否包含入团申请书需根据个人入团经历和档案建立时间进行区分：

一、档案袋包含入团申请书的情况

1. 已办理入团手续的团员

   若个人在中学阶段已正式办理入团手续，入团申请书作为申请入团的核心材料，通常会被纳入档案袋中。

2. 档案建立时已存在入团材料

   即使档案袋初始为空，只要在档案建立时（如高中阶段）已提交入团申请书并完成入团流程，该材料仍会被保存。

二、档案袋不包含入团申请书的情况

1. 未办理入团手续的团员

   若个人在中学阶段未正式申请入团，则不会有入团申请书，档案袋中自然不包含该材料。

2. 流动团员或未转接材料的团员

   部分流动团员可能因未办理材料转接手续而失去团员身份，此时档案袋中也不会有入团申请书。

三、其他注意事项

• 团员证与档案的区别

  团员证是团员身份的证明文件，而档案是入团申请材料的集合体。两者不可替代，需注意区分。

• 档案内容范围

  除入团申请书外，档案袋通常还包括入团志愿书、团员登记表、表彰记录、思想汇报等材料。

建议团员定期向学校团委核查档案内容，确保入团材料的完整性。若发现材料缺失，应及时补全相关手续。