合肥工业大学分为合肥校区（含屯溪路、翡翠湖、六安路）和宣城校区，主要区别体现为地理位置、设施完善度、专业设置和师资水平差异，其中合肥校区作为主校区历史更悠久，宣城校区注重应用型人才培养。

合肥校区位于安徽省会合肥市，核心校区包括屯溪路校区和翡翠湖校区，其中屯溪路校区是历史最悠久的校区，位于市中心，交通便利，毗邻政务与商业区，拥有国家级实验室和省级文物保护建筑，以机械工程、车辆工程等传统工科为重点，实验室和科研资源积累深厚，涵盖4个国家级实验教学示范中心及多个工程实践中心；翡翠湖校区则为现代化主校区，校园环境优美，设施先进，聚焦计算机、建筑等新兴学科。六安路校区原属安徽工学院，现承接继续教育及部分行政职能。相比之下，宣城校区于2012年启用，地处宣城市，占地约3135亩，环境清幽，主打新能源、食品科学等区域经济特色专业，实验室设备全新且由地方政府支持，但设施细节尚不及合肥校区，专业设置以独占学科为主，如食品科学系。

师资与教学管理方面，合肥校区依托历史积淀，汇聚资深教授和国家级高层次人才，推行“校企双导师制”，注重学术深度，部分专业保研率及深造率更高，国际交流项目丰富；宣城校区师资呈年轻化趋势，部分专业由合肥校区统一培养，未来师资水平将逐步提升。录取分数线上，合肥校区整体高于宣城，尤其在热门专业如计算机领域，但两校区共享“双一流”学科资源，培养方案统一，宣城校区因竞争较小对分数略低学生更具吸引力。

综合而言，合肥校区适合追求深度学术、实习便利及传统工科方向的学生，而宣城校区则以新兴学科、较低竞争压力及区域特色见长，考可根据分数定位、专业侧重及生活偏好决定目标校区。