杭州拱墅区的房价相对较低可能有以下几个原因：

1. 地理位置：拱墅区虽然位于杭州市中心区域，但其北部和东部与余杭区、西湖区相邻，南部则接壤上城区，这种地理位置使得拱墅区的部分区域在交通和城市规划上可能不如市中心区域那么便捷和集中。

2. 市场供需关系：根据市场数据，拱墅区的二手房均价在过去一年中经历了波动，整体呈现下滑趋势，这可能反映了市场供需关系的变化，供大于求可能导致房价下降。

3. 区域发展和规划：拱墅区正在经历城市更新和产业升级，虽然这可能会带来长期的发展潜力，但短期内可能会因为大规模的建设而影响房价。

4. 基础设施和公共服务：虽然拱墅区在基础设施和公共服务方面有所改善，但与市中心区域相比，可能仍存在一定的差距，这可能会影响房价。

5. 历史因素：拱墅区有着悠久的历史，曾是杭州的老工业基地，随着城市的发展和产业的转型，一些老工业区域可能面临房价上涨的压力。

6. 政策调控：国家和地方政府对房地产市场的调控政策也会影响房价，如限购、限贷等政策可能会对房价产生一定的压制作用。

需要注意的是，房价受多种因素影响，具体情况可能会有所不同。购房者在做出购房决策前，应充分了解市场动态和相关政策，谨慎评估自身的经济实力和购房需求。