长春工程学院共有‌15个院系‌，涵盖工学、理学、管理学、艺术学等多个学科门类，形成了‌多学科协调发展的办学格局‌。

1. ‌土木工程学院‌：以土木工程为核心，培养建筑工程、道路桥梁等领域的高素质应用型人才。
2. ‌水利与环境工程学院‌：专注于水利工程、环境工程等方向，服务国家水利建设和生态保护需求。
3. ‌电气与信息工程学院‌：涵盖电气工程、自动化、计算机科学与技术等专业，培养信息技术与智能控制人才。
4. ‌机电工程学院‌：聚焦机械设计制造、车辆工程等领域，强化实践能力与技术创新。
5. ‌建筑与设计学院‌：开设建筑学、城乡规划、环境设计等专业，注重艺术与工程的结合。
6. ‌能源动力工程学院‌：围绕能源与动力工程，培养能源开发、节能减排方面的专业人才。
7. ‌计算机技术与工程学院‌：侧重软件工程、网络工程、人工智能等前沿技术领域。
8. ‌管理学院‌：提供工商管理、会计学、物流管理等课程，培养复合型管理人才。
9. ‌理学院‌：涵盖数学、物理等基础学科，支撑学校理工科专业的理论教学。
10. ‌外国语学院‌：开设英语、日语等语言专业，提升学生的国际交流能力。
11. ‌材料科学与工程学院‌：研究新材料技术，服务制造业升级与材料创新。
12. ‌测绘与勘查工程学院‌：培养测绘工程、地质工程等领域的专业技术人才。
13. ‌国际教育学院‌：负责留学生教育及国际合作项目，推动国际化办学。
14. ‌继续教育学院‌：开展成人教育、职业培训等，服务社会终身学习需求。
15. ‌马克思主义学院‌：承担思想政治理论课教学，强化学生的价值观教育。

长春工程学院的院系设置紧密结合行业需求，为学生提供多样化的专业选择，助力培养适应社会发展的应用型人才。