在科目三考试中，不按安全员指令驾驶属于严重违规行为，可能导致考试不合格。

科目三，又称道路驾驶技能考试，是机动车驾驶证考核的一部分。在考试过程中，安全员会根据考试项目和实际情况发出指令，考生需要按照指令进行驾驶操作。如果考生不按安全员指令驾驶，可能会产生以下后果：

1. 考试不合格：科目三考试有严格的评判标准，不按指令驾驶属于违规行为，会直接导致考试不合格。这意味着考生需要重新预约考试，浪费时间和精力。

2. 安全风险：安全员的指令通常基于交通安全和考试要求，不按指令驾驶可能导致危险驾驶行为，如闯红灯、逆行等，增加交通事故的风险。

3. 信任问题：安全员是考试的监督者和指导者，不按指令驾驶可能被视为对安全员的不尊重或不信任，影响考生在考试中的表现和评分。

4. 法律责任：在实际道路上，驾驶员需要遵守交通规则和交警指令。不按安全员指令驾驶可能被视为不遵守交通规则，如果发生事故，考生可能需要承担相应的法律责任。

在科目三考试中，考生应该严格遵守安全员的指令，确保驾驶安全和考试顺利进行。如果对指令有疑问，应及时向安全员咨询，避免因误解或疏忽导致违规行为。考生也应该在平时的练习中熟悉考试流程和指令要求，提高驾驶技能和应变能力。