全国学籍系统删除重复学籍需按以下流程操作，具体步骤如下：

一、处理流程

1. 联系学校学籍管理员

   首先需与学校学籍管理部门取得联系，提交删除申请及证明材料（如户口簿、身份证等），由学校核实信息并提交至系统。

2. 登录学籍管理系统操作

   学校审核通过后，登录全国学籍管理系统，在“综合查询”或“在校生查询”中选中重复学籍，逐一提交“申请删除”。

3. 教育局审核流程

   学校删除申请需逐级上报至主管教育局，由教育局审核并批准后，系统方可最终删除重复学籍。

二、特殊情况处理

• 信息录入错误 ：若因系统或材料问题导致重复，需提交变更申请并附正确信息。

• 身份信息冲突 ：若存在同名或身份证号错误，需提供户口簿、学校证明等材料佐证身份。

三、注意事项

• 操作需在学籍数据被教育部门核查后进行，避免自行删除影响正常注册。

• 若学校或教育局处理困难，可拨打全国教育考试院电话（010-82951117）寻求帮助。