农村耕地永久退出补偿计算方法主要依据土地类型、面积、质量、区位以及当地经济发展水平等因素进行综合评估，确保农民权益得到合理保障。具体补偿标准由地方政府根据实际情况制定，但通常会包含以下几方面的考量：

1. 1.土地类型与面积：不同的土地类型（如水田、旱地、园地等）其补偿标准会有所差异。通常情况下，水田的补偿标准会高于旱地，因为水田的生产力更高。补偿金额通常按照实际测量面积计算，确保农民能够获得与其土地面积相符的补偿。
2. 2.土地质量与区位：土地的质量是影响补偿金额的重要因素。高质量的土地通常具有更高的生产力，因此补偿标准也相应提高。土地的区位也会影响补偿金额。位于城市周边或交通便利地区的土地，由于其潜在的开发价值较高，补偿标准通常会高于偏远地区的土地。
3. 3.当地经济发展水平：地方经济发展水平是制定补偿标准的重要参考依据。经济发达地区通常能够提供更高的补偿金额，以反映土地的实际市场价值。地方政府会参考当地土地市场的价格水平，确保补偿标准与市场趋势相符。
4. 4.农民后续生活保障：除了直接的货币补偿，许多地方政府还会提供其他形式的保障措施，如就业培训、社会保障等，以帮助农民在退出耕地后能够顺利过渡到新的生活方式。一些地区还会设立专项基金，用于支持农民发展其他产业，确保其长期的经济来源。
5. 5.政策与程序透明性：为了确保补偿过程的公平公正，地方政府通常会制定详细的政策文件和操作流程，并向农民公开。补偿方案的制定和实施过程中，会充分听取农民的意见和建议，确保其合法权益得到充分尊重。

农村耕地永久退出补偿的计算是一个多因素综合考量的过程，旨在保障农民的切身利益。通过合理的补偿标准和后续保障措施，农民能够在退出耕地后获得稳定的生活保障。政策的透明性和程序的公正性也是确保补偿工作顺利进行的重要保障。农民在面临耕地退出时，应充分了解相关政策，积极参与补偿方案的制定，以确保自身权益得到最大程度的保障。