新疆吐鲁番市下辖​​1个区（高昌区）、2个县（鄯善县、托克逊县）​​，共包含​​19个镇​​，其中​​高昌区6镇、鄯善县5镇、托克逊县8镇​​。​​特色镇​​如葡萄镇（葡萄沟核心区）、鲁克沁镇（木卡姆艺术之乡）、火焰山镇（西游记文化地标）兼具自然与人文资源，是丝路旅游的重要节点。

• ​​高昌区​​：七泉湖镇（工业重镇）、大河沿镇（交通枢纽）、亚尔镇（交河故城所在地）、艾丁湖镇（中国大陆最低点）、葡萄镇（葡萄种植基地）、火焰山镇（红色砂岩地貌）。
• ​​鄯善县​​：鄯善镇（县域中心）、七克台镇（彩玉之乡）、火车站镇（物流集散地）、连木沁镇（哈密瓜产区）、鲁克沁镇（历史文化名镇）。
• ​​托克逊县​​：托克逊镇（县域核心）、库米什镇（矿产丰富）、克尔碱镇（草原风光）、阿乐惠镇（工业新区）、伊拉湖镇（杏花胜地）、夏镇（农业示范区）、博斯坦镇（牧业基地）、郭勒布依乡（民族风情）。

吐鲁番的镇域分布体现了绿洲经济与多元文化交融的特点，游客可沿“火焰山-葡萄沟-艾丁湖”主线探索，或深入鲁克沁、克尔碱等小镇体验民俗与生态。