个体户通过自然人电子税务局申报经营所得的流程可分为以下五个步骤，具体操作如下：

一、登录系统

1. 网页端登录

   访问国家税务总局电子税务局官网（https://etax.chinatax.gov.cn），输入统一社会信用代码、办税人身份证号及密码登录。

2. 扣缴端登录

   下载并安装自然人电子税务局扣缴客户端（电脑端），通过扫码或密码登录。

二、进入申报模块

登录后，在首页选择【我要办税】-【经营所得（A表）】或【经营所得】-【预缴纳税申报】进入申报页面。

三、填写申报表

1. 基础信息

   选择申报年度（如2025年），输入统一社会信用代码，确认商户信息及税款所属期（如2025年1-9月）。

2. 收入与成本

   累计填报收入总额、营业成本及费用，注意区分综合所得与经营所得的减除费用（如工资薪金5000元/月不可重复扣除）。

3. 减免税额

   如适用，勾选减免税信息（如专项附加扣除）。

四、提交与缴税

1. 提交申报

   核对信息无误后点击【提交】，完成季度预缴申报。

2. 税款缴纳

   选择扫码支付或银行转账等方式缴纳税款，系统将自动计算应纳税额。

五、年度汇算清缴（可选）

若存在两处以上经营所得，需在次年3月1日至6月30日通过扣缴端或WEB端完成年度汇总申报（C表），并报送《个人所得税经营所得纳税申报表》。

注意事项 ：

• 申报前需确保已采集法人身份信息及经营数据准确；

• 亏损企业可直接提交申报，无需调整数据；

• 选择综合所得与经营所得时，需注意费用扣除的排他性。