根据《中华人民共和国社会保险法》及相关政策规定，灵活就业申请后未缴费的处理方式如下：

一、处理方式

1. 可撤销申请

   若申请已受理但未缴费，可在社保局审批前通过线上平台（如社保官网）或线下窗口取消申报。

2. 主动补缴

   • 补缴期限 ：需在欠费发生当月起3年内完成补缴，且断缴时间不超过3个月。

   • 操作流程 ：携带身份证件至社保经办机构或线上平台办理补缴，部分地区支持滞纳金减免。

3. 影响与后果

   • 短期影响 ：医保中断期间住院需自付费用，养老金累计缴费不足15年可能降低领取金额。

   • 长期影响 ：超过3个月未补缴可能无法享受社保待遇，甚至面临账户注销风险。

二、注意事项

• 政策差异 ：不同地区退费/补缴政策可能不同，建议咨询当地人社部门。

• 信用记录 ：长期欠费可能影响个人信用。

• 灵活就业类型 ：仅灵活就业人员可缴纳医保和养老保险，其他类型（如无雇工个体工商户）需单独处理。

三、建议

• 及时沟通 ：联系社保局了解具体流程和时效要求。

• 保留凭证 ：补缴时需提供缴费记录以备后续查询。