国库支付系统通常在每年12月关闭的主要原因如下：

1. 年度支出任务完成

   地方财政部门会在年底前完成当年预算执行任务，包括各类支出项目的资金拨付。例如广西民族师范学院在2018年12月18日因年度支出任务完成提前关闭支付系统。

2. 财政资金清算与结算

   12月是财政年度末，需对全年资金进行清算、结算及对账工作，确保财政资金安全、准确。此时关闭支付系统可避免跨年度操作风险。

3. 预算执行进度控制

   通过统一关闭支付系统，财政部门可控制预算执行进度，防止超支或资金闲置。例如浙江财经大学要求2012年国库专项经费在2013年底前使用完毕。

4. 资金调度与优化

   年底关闭系统便于财政部门统一调度资金，优化资源配置。例如广西民族师范学院因支付系统关闭导致自有资金不足，需延迟非紧急支出。

总结 ：12月关闭国库支付系统是财政年度管理常规操作，旨在完成年度任务、保障资金安全及优化资源配置。若遇特殊情况，可提前与相关部门沟通协调。