专用结余与非财政拨款结余的区别主要体现在定义、核算基础及用途三个方面，具体如下：

一、定义区别

1. 专用结余

   仅指从 非财政拨款结余或经营结余中提取的基金 ，属于预算会计科目，用于核算单位预算执行后的结余情况。

2. 非财政拨款结余

   是事业单位预算会计中反映单位非财政拨款收支执行结果的科目，包括收入、支出及结余三部分，属于预算会计的核心指标。

二、核算基础差异

• 专用结余 ：采用 收付实现制 核算，以实际收支为依据。

• 非财政拨款结余 ：采用 权责发生制 核算，以权利和责任的发生为确认依据。

三、用途与分类

• 专用结余 ：主要用于核算单位预算执行后的结余，属于预算会计类科目。

• 非财政拨款结余 ：包含单位非财政拨款的收入、支出及结余，属于财务会计类科目，反映单位净资产变动情况。

四、关联说明

• 从非财政拨款结余中提取的专用基金，其 计提数与专用结余一致 ，但两者属于不同会计科目的核算范畴。

总结 ：专用结余是非财政拨款结余中提取基金在预算会计中的体现，二者在定义、核算基础及用途上存在本质区别，需分别进行会计处理。