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科二不合格的原因教练是可以查出来的 。以下是几种可能的方式：

1. 驾校档案 ：驾校会有学员的档案记录，包括各科考试的成绩和不合格的原因。学员考完后，可以去驾校的柜机里打印出相关记录。

2. 语音播报 ：在考试时，如果学员不合格，会有语音播报提示具体的扣分原因。虽然教练不能直接看到扣分原因，但可以通过询问学员来得知。

3. 监控录像 ：现在很多考场都有监控录像，教练可以通过查看监控录像，分析学员在考试中的操作，从而找出失败的原因。

4. 成绩分析 ：教练通常会在训练过程中观察学员的操作和技巧，并在考试后与学员一起分析错误，找出问题所在并给出改进建议。

5. 法律权利 ：从法律角度，考生有权知道自己的考试成绩和挂科的具体原因。教练可以根据这些信息帮助学员了解挂科原因，并提供相应的指导以改进。

综上所述，教练有多种途径可以查找到学员在科目二考试中不合格的原因。建议学员在考试后主动与教练沟通，了解自己的不足之处，并在教练的指导下进行改进，以便在下次考试中取得更好的成绩。