根据相关规定，如果学员在科目二考试中连续五次未能通过，将会面临以下后果：

1. 已考试合格的其他科目成绩作废 ：学员需要重新从科目一开始考试，之前已通过的其他科目成绩将不再有效。

2. 重新报名和培训 ：学员需要重新报名参加驾校培训，并支付相应的考试费用。这意味着学员将需要重新开始学习科目一，并重新预约科目二考试。

3. 心理调整 ：连续多次考试失败可能会对学员的自信心造成打击。在等待期间，学员可以通过心理辅导或自我调整来恢复信心，并准备好再次面对挑战。

4. 法律和等待期 ：根据不同地区的规定，学员可能需要等待一段时间（通常是几个月）才能再次预约科目二考试。在这段时间内，学员应加强练习和提高技能，并确保遵守当地的交通法规，避免无证驾驶。

5. 长期规划 ：如果学员在科目二考试上一直未能通过，可能需要考虑是否继续追求驾驶证，或者寻找其他替代的交通方式。

综上所述，科目二考试五次不通过的后果较为严重，学员需要重新投入时间和金钱进行学习和考试。因此，建议学员在考试前做好充分的准备，调整好心态，以提高通过考试的几率。