独立院校与三本的区别主要体现在办学性质、层次、资质、学费及招生政策等方面，具体如下：

一、办学性质与层次

1. 独立院校

   • 由普通高校与社会力量合作办学，属于教育部行政规章设立，一定是本科层次。

   • 部分独立院校可能跨一本、二本、三本招生，例如北京师范大学珠海校区为二本院校。

2. 三本院校

   • 包含独立学院和民办本科，通常指教育部直属或省属的本科高校，属于公立学校。

   • 三本批次招生，主要面向专科生升本科。

二、办学资质与资源

1. 独立院校

   • 没有学位授予权限，需通过合作方高校共享师资、教学资源。

   • 部分独立学院可能转设为民办大学，获得独立法人资格。

2. 三本院校

   • 拥有国家授权的学位授予权，由政府投资建设，师资和设施更完善。

三、学费差异

• 独立院校 ：学费普遍较高，通常在1万-1.6万元/年，部分依赖社会捐赠。

• 三本院校 ：学费相对较低，民办本科约5000-1万元/年。

四、招生政策

• 独立院校 ：部分可自主招生，部分与三本批次合并招生。

• 三本院校 ：统一通过高考等统一考试录取，招生批次固定。

五、毕业证书

• 独立院校 ：毕业证加盖合作方高校名称印章（如“某某大学某某学院”），部分省份认可度较低。

• 三本院校 ：毕业证直接加盖本校名称印章，认可度更高。

总结 ：独立院校多为三本中的民办或合作办学，三本院校包含独立学院及公办本科。选择时需结合办学资质、资源、学费及个人需求综合考量。