大专档案丢失后，可以存本科档案，但需注意以下要点：

1. 本科档案可单独存档

   根据权威信息，本科档案可以存放在人才市场、公共就业服务机构或具有人事档案管理权限的单位，无需依赖大专档案。但需确保材料齐全（如高中/中专档案、本科毕业证等）。

2. 大专档案补办与合并建议

   • 补办流程 ：联系高中/中专和大专院校开具学籍证明，携带材料到原就读大学密封后提交，补办完成后的档案需移交户籍地人社局或人才中心。

   • 合并存档 ：若补办成功，建议将大专档案与本科档案合并，以提升档案完整性，便于求职或升学。

3. 影响专升本/公务员政审的情况

   若大专档案丢失且未补办，可能影响专升本录取或公务员政审，因部分单位会核查大专期间的表现。建议优先补办大专档案。

4. 存档单位选择

   优先选择户籍地人才中心或公共就业服务机构，这类单位档案接收更规范，且与户籍信息关联。若需存入单位，需确认单位具有人事档案管理权限。

总结 ：大专档案丢失不影响本科档案单独存档，但建议尽快补办大专档案并合并，以确保档案完整性。