井冈山大学和九江学院各有优势，选择需结合个人需求：井冈山大学以红色文化底蕴和研究生教育见长，尤其在马克思主义理论、生物学等学科实力突出；九江学院则以医学专业**（如口腔医学、临床医学）和会计学等应用型学科著称，且地理位置更优越（毗邻庐山、长江）。**

1. 学科特色对比
   井冈山大学拥有3个一级学科硕士点和11个专业硕士点，重点发展马克思主义理论、生物学及环境科学与工程等学科，适合学术深造。九江学院的王牌专业包括4个国家级一流本科专业（会计学、微电子科学与工程等），医学院实力强劲，附属医院资源丰富，适合实践导向型学生。

2. 地理位置与文化环境
   井冈山大学位于吉安市，依托井冈山红色资源，校园文化强调革命精神传承；九江学院坐落在九江市，毗邻庐山、鄱阳湖，兼具自然与历史文化优势，生活便利性更高。

3. 硬件设施与生活条件
   九江学院部分宿舍条件较差（如无独立卫浴），但新校区设施较好；井冈山大学校园环境整体评价较优，但两校均存在设施分布不均的问题。

总结：学术研究或红色文化偏好者可选井冈山大学；注重医学、商科或区位优势的学生更适合九江学院。建议实地考察或咨询在校生以获取更直观体验。