教师资格证一年只能认定一门的原因主要有以下几点：

1. 避免资源分配不均 ：限制同一申请人每年只能申请认定一种教师资格，可以确保教育资源更加合理地分配，避免因资格认定过多而导致的资源浪费或质量下降。

2. 保证教育质量 ：教师是一个神圣的职业，要求教师具备必要的教育教学能力。通过限制认定次数，可以促使申请者更加慎重地选择适合自己的教师资格，并在一定时间内优先选择其中一门进行认定，从而确保教师队伍的整体素质。

3. 控制教师人数增长 ：限制教师资格认定的数量，有助于控制教师人数的增长，使教育资源可以更合理地配置，避免因教师过多而导致的恶性竞争和教学质量下降。

4. 确保培训质量 ：获得教师资格需要经过系统的培训和考核。如果一年可以认定多种教师资格，可能会导致申请者无法集中精力进行充分的准备和培训，从而影响培训质量和教师资格的含金量。

综上所述，限制教师资格认定的数量，旨在确保教育资源的合理分配、提高教师队伍的整体素质、控制教师人数的增长，并保证培训质量。因此，同一申请人每年只能申请认定一种教师资格。