人力资源部门在处理劳动争议时，主要遵循以下步骤：

1. 制定合理的劳动合同 ：人力资源部门需要制定明确、具有可执行性的劳动合同，确保合同中的条款合法合规，防止潜在争议的发生。

2. 提供咨询和指导 ：人力资源部门应提供员工的劳动法律法规咨询，解答员工对劳动条件、权益等方面的疑问，并向员工提供合法权益的指导。

3. 调解与协商 ：人力资源部门需要充分发挥调解与协商的作用，尽力促成劳动争议双方的和解。通过公正、客观的态度，协助双方妥善解决争议，增进双方的合作与理解。

4. 进行调查与证据收集 ：人力资源部门需要进行相关调查和证据收集，确保依据实际情况作出公正的决策与处理。收集证据过程中，应对相关信息保密，并保证调查全面、客观。

5. 协调与沟通 ：人力资源部门需要与相关部门进行沟通与协调，寻求更广泛的建议与意见。与劳动争议相关的制度、政策，需要与其他部门共同制定和完善。

6. 申请调解 ：发生劳动争议后，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解。

7. 申请仲裁 ：如果调解不成，当事人可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，仲裁委员会将根据双方提供的证据进行仲裁。

8. 提起诉讼 ：对仲裁裁决不服的，除《劳动争议调解仲裁法》另有规定外，当事人可以向人民法院提起诉讼。

9. 执行仲裁裁决 ：如果一方不履行仲裁裁决，另一方可以依法向有管辖权的法院申请强制执行。

通过以上步骤，人力资源部门可以有效地处理劳动争议，维护劳动者和用人单位的合法权益。建议企业建立健全内部沟通渠道，提升员工的法律意识，预防劳动争议的发生。