单位是否会检查员工的执业药师证，这主要取决于单位的性质以及相关法律法规的要求。如果是一家药品零售企业、医疗机构或其他需要提供药学服务的单位，那么对执业药师证书的核查是非常重要的。以下是一些具体的情况和相关的细节：

单位内部管理

在一些情况下，单位可能会定期或不定期地对员工持有的执业药师证书进行审核，以确保其合法性和有效性。例如，在药品零售企业中，为了保证药店的正常运营并符合国家关于配备执业药师的规定，管理层可能会要求员工出示他们的执业药师证书，并确认这些证书的有效性。这是因为根据规定，药店必须配备持有有效执业药师证书的专业人员，否则将面临处罚。

注册与继续教育

当涉及到执业药师的注册问题时，单位一般不会直接去查询员工的执业资格证书，而是由执业药师本人向当地药品监督管理部门申请注册。不过，单位应当知道，持证人需按规定参加继续教育学习，这是维持注册状态的一个必要条件。单位可能也会鼓励和支持员工完成必要的继续教育课程，以保持证书的有效性。

政府监管与检查

更重要的是，政府相关部门会对单位进行监督检查，包括但不限于对执业药师证书的真实性及持证人在岗情况的核实。比如，各地药品监督管理局会开展专项检查行动，检查内容涵盖执业药师是否在职在岗、是否存在挂证行为等。一旦发现有违规行为，如挂证现象，不仅持证人会被撤销《执业药师注册证》，而且涉及的药店也可能受到严厉惩罚，甚至失去医保定点资格。

特殊情况处理

值得注意的是，如果单位试图扣押员工的执业药师证书，这种做法是违法的。依据法律规定，任何单位和个人未经发证机关批准不得扣押执业药师证，若遇到此类情况，员工有权向上级主管部门投诉或直接向法院提起诉讼。

虽然单位本身不一定主动去查员工的执业药师证，但在特定情境下（如满足行业标准、应对监管部门检查等），确实需要验证证书的真实性和有效性。同时，作为执业药师，应始终保持证书的有效状态，并遵守相关规定，以避免因证书问题给个人职业发展带来不利影响。而作为雇主，则应尊重员工的权利，不非法扣押证件，并积极支持员工的职业发展需求。