根据我国住院医师规范化培训的相关政策，规培三年未通过考试的处理方式如下：

一、基本规定

1. 规培时间限制

   国家明确规定住院医师规范化培训总时长为3年，未通过考核需重新参加规培。

2. 补考政策

   结业考核仅提供1次机会，未通过后需重新参加规培招聘考试并完成3年规培。

二、具体处理流程

1. 首次未通过

   • 需重新参加规培招聘考试并完成3年规培。

   • 期间无法获得规培证，影响执业医师资格证申请。

2. 连续两年未通过

   • 若连续两年未通过执业医师考试，规培将终止，需重新开始规培。

3. 特殊情况处理

   • 执业医师考试未通过 ：需先通过执业医师考试，再申请规培。

   • 单科未通过 ：需进入下一考核周期（第三年），重新考两门课程。

三、其他注意事项

• 地区政策差异 ：部分省份或医院可能对规培未通过者有额外限制（如三年内不得重新报名），需提前咨询当地卫生行政部门。

• 职业规划建议 ：若多次未通过，建议评估职业方向，或考虑其他医疗领域发展。

综上，规培三年未通过需重新参加规培，且需通过执业医师考试，具体流程和限制需结合当地政策执行。