安徽省理科高考6000名能上的学校包括以下几所：

1. 中国科学技术大学 ：虽然中国科学技术大学的预估最低录取排名是理科前600名，但根据招生老师的说法，前600名的人也有被录取的可能性。

2. 中央财经大学 ：中央财经大学在安徽的理科预估录取排名是6000名以内，其中国际经济与贸易专业理科排名9000名以内均可以报考。

3. 安徽师范大学 和 安徽财经大学 ：这两所学校在安徽省理科6000名左右的录取情况较为乐观，可以冲刺报考。

4. 安徽农业大学 和 安徽建筑大学 ：这些学校也是安徽省内理科6000名左右的选择之一。

5. 东北石油大学 、 长春理工大学 、 江西中医药大学 和 辽宁科技大学 ：这些学校也适合理科排名6000名的学生报考。

6. 河南师范大学 和 湖南科技大学 ：这两所学校在安徽省理科5万名的录取位次范围内，因此理科6000名的学生也有机会报考。

7. 合肥工业大学 和 安徽大学 ：作为安徽省内的211高校，这两所学校对于理科6000名的学生来说，录取概率较大。

综合以上信息，理科高考6000名的学生在安徽省内可以报考中国科学技术大学、中央财经大学、安徽师范大学、安徽财经大学、安徽农业大学、安徽建筑大学、东北石油大学、长春理工大学、江西中医药大学、辽宁科技大学、河南师范大学、湖南科技大学、合肥工业大学和安徽大学等学校。建议根据个人兴趣和职业规划，综合考虑这些学校的录取情况和专业特点，选择最适合自己的学校。