道路运输经营许可证的办理部门根据经营范围和行政级别有所不同，具体如下：

一、办理部门

1. 县级道路运输管理机构

   • 负责办理县级行政区域内及毗邻县行政区域间的道路运输经营许可。

   • 申请人需向县级政务服务中心交通局窗口提交申请。

2. 市级道路运输管理机构

   • 负责省际、市际（非毗邻县）道路运输经营许可的审批。

二、办理流程（以县级为例）

1. 提交申请

   • 填写《道路运输经营许可证申请表》，并提交企业章程、车辆技术性能证明、驾驶员资格证等材料。

2. 材料审核与现场核查

   • 部门对材料进行审核，符合条件的进入现场核查，确保车辆、人员等实际情况与申请一致。

3. 审批与发证

   • 审批通过后，颁发《道路运输经营许可证》，并核发车辆营运证。

三、办理时效

• 县级部门需在受理申请后20日内作出许可或不予许可的决定。

四、注意事项

• 避免混淆：道路运输经营许可证与车辆营运证不同，前者是经营资格证，后者是车辆上路凭证。

• 有效期为4年，到期需换证。

若需跨省经营，需向设区的市级机构申请，具体材料要求以当地最新政策为准。