Python文件通常存放在‌项目根目录‌、‌特定功能目录‌或‌虚拟环境目录‌中，‌关键存放原则‌包括：‌路径清晰‌、‌模块化分类‌和‌环境隔离‌。以下是具体存放场景和建议：

1. ‌项目根目录‌
   小型项目可直接将.py文件放在根目录下，便于直接运行和导入。例如main.py和config.py这类核心文件通常置于此处。避免堆砌过多文件，建议通过子目录分类管理。

2. ‌功能模块目录‌
   按功能划分目录结构，例如：

   • /utils/存放工具类脚本
   • /tests/保存单元测试文件
   • /models/放置数据模型相关代码
     这种结构符合‌Python包规范‌，需在目录中添加__init__.py文件（可为空）以支持模块导入。

3. ‌虚拟环境相关路径‌
   使用venv或conda时，第三方库会安装在虚拟环境的Lib/site-packages/中，但‌切勿手动修改该目录‌。项目自开发的依赖模块建议通过pip install -e .以可编辑模式安装到虚拟环境。

4. ‌系统路径与自定义路径‌
   若需全局调用某些模块，可通过以下方式处理：

   • 将项目目录添加到PYTHONPATH环境变量
   • 在代码中使用sys.path.append()临时添加路径
     但需注意‌路径优先级问题‌，避免与系统库冲突。

5. ‌特殊场景存放‌

   • Jupyter Notebook的.ipynb文件建议单独建立/notebooks/目录
   • 临时脚本可存放在/tmp/或/scratch/目录
   • 配置文件（如.json/.yaml）推荐与代码分离，通过绝对或相对路径引用

合理规划文件位置能显著提升项目可维护性。建议结合os.path标准库处理路径操作，并遵循‌PEP 8‌关于导入风格的约定。对于复杂项目，可使用setuptools或poetry工具规范目录结构。