计算机软件著作权（简称“软著”）和专利是两种不同的知识产权保护方式，它们在保护对象、保护范围、申请流程、保护期限等方面存在显著区别。以下是它们的主要区别：
1. 保护对象
计算机软件著作权：
保护的是计算机程序及其相关文档。计算机程序是指能够实现一定功能的代码化指令序列，文档是指用于描述程序的内容、组成、设计、功能规格、开发情况、测试结果及使用方法的文字资料和图表等。
例如，一款软件的源代码、用户手册、设计文档等都可以受到软著保护。
专利：
保护的是发明创造，包括发明、实用新型和外观设计。在计算机领域，专利通常保护的是技术方案、技术方法或技术产品，而不是单纯的软件代码。
例如，一种新的软件算法、一种软件与硬件结合的创新系统、一种改进的软件架构等可以申请专利。
2. 保护范围
计算机软件著作权：
主要保护软件的表达形式，即代码和文档。它强调的是“独创性”，只要软件是开发者独立开发的，并且有一定的创造性，就可以获得保护。
保护范围相对较窄，主要防止他人抄袭、复制或未经授权的传播。
专利：
保护的是技术方案本身，而不仅仅是实现方式。专利要求技术方案具有“新颖性、创造性和实用性”。
保护范围更广，不仅可以防止他人抄袭，还可以防止他人通过其他方式实现相同的技术效果。
3. 申请流程
计算机软件著作权：
申请相对简单，主要是提交软件的源代码、文档、用户手册等材料，填写申请表，缴纳一定的费用。
审查周期较短，一般在几个月内可以完成登记。
专利：
申请流程较为复杂，需要撰写详细的专利说明书、权利要求书、附图等。申请后需要经过形式审查、实质审查等环节。
审查周期较长，发明专利一般需要2-3年，甚至更久；实用新型专利和外观设计专利相对较快，但也需要1-2年。
4. 保护期限
计算机软件著作权：
自然人的软件著作权保护期限为自然人终生及其死亡后50年；法人或者其他组织的软件著作权保护期限为50年，自软件首次发表之日起计算。
专利：
发明专利的保护期限为20年，实用新型专利和外观设计专利的保护期限为10年，均自申请日起计算。
5. 保护力度
计算机软件著作权：
主要针对软件的复制、传播、修改等行为进行保护。如果他人独立开发出相同或类似的软件，不构成侵权。
专利：
保护力度更强，只要他人实施了相同或等同的技术方案，无论其是否独立开发，都可能构成侵权。
6. 适用场景
计算机软件著作权：
更适合保护软件的代码和文档，尤其是商业软件、开源软件等。
专利：
更适合保护具有技术创新性的软件相关技术，例如软件算法、软件与硬件结合的系统、软件架构等。
7. 费用
计算机软件著作权：
申请费用相对较低，一般在几百元人民币。
专利：
申请费用较高，尤其是发明专利，申请费用可能达到数千元，加上代理费等，成本更高。
总结
如果你的目标是保护软件的代码和文档，防止他人抄袭或未经授权的使用，可以选择计算机软件著作权。
如果你的技术方案具有较高的创新性，希望通过更强大的法律保护来阻止他人使用相同或类似的技术，那么专利可能是更好的选择。
在实际应用中，很多软件企业会同时申请软著和专利，以实现更全面的保护。