二本和三本学校的主要区别体现在录取批次、办学性质、学费标准及社会认可度上：二本多为公办院校，学费较低且社会认可度高；三本则以民办/独立学院为主，学费较高但近年来就业竞争力逐步提升。

1. 录取批次与分数线
   二本属于本科第二批次录取，分数线高于三本（第三批次）。高考填报志愿时，二本院校优先投档，三本通常在二本录取结束后进行，因此三本录取门槛相对较低。

2. 办学性质与资源
   二本院校多为省属或市属公办高校，享受财政拨款，师资和硬件设施较有保障；三本主要为民办高校或与公办校合办的独立学院，经费自筹，部分专业可能依托母体学校资源，但整体科研投入较弱。

3. 学费与成本差异
   二本学费普遍在4000-6000元/年，而三本学费通常高达12000-15000元/年，主要因民办性质需自负盈亏。部分三本院校通过校企合作提供实践机会，但成本较高。

4. 社会认可与就业前景
   二本毕业生因公办背景更受传统企业青睐，尤其在公务员、事业单位招考中优势明显；三本院校虽初期认可度较低，但随着应用型人才培养的强化，部分专业（如IT、设计）的就业竞争力已与二本持平，更看重个人能力。

总结：二本和三本均为国家承认的本科学历，选择时需结合家庭经济、专业特色及职业规划综合考量，三本的优势专业同样能提供良好发展机会。