cx_Freeze和PyInstaller是Python打包工具的两大主流选择，核心差异在于跨平台灵活性、配置方式和打包效率。cx_Freeze以跨平台开发见长，适合需要多系统部署的项目；PyInstaller则凭借简单易用和快速打包，成为中小型项目的首选。

关键对比点

1. 跨平台支持
   cx_Freeze允许在Windows开发后直接打包为Linux或Mac程序，适合跨平台需求明确的项目。PyInstaller虽也支持多平台，但需在对应系统环境下分别打包，灵活性稍逊。

2. 配置复杂度
   PyInstaller通过命令行参数即可完成基础打包（如--onefile生成单文件），适合新手快速上手。cx_Freeze需编写setup.py文件，配置更灵活但学习成本较高，适合需要精细控制依赖或资源的高级用户。

3. 输出体积与效率
   PyInstaller默认包含全部依赖，生成文件体积较大，但打包速度快；cx_Freeze通过手动配置可精简依赖，适合对体积敏感的大型项目，但打包过程相对耗时。

4. 第三方库兼容性
   PyInstaller自动检测依赖的能力更强，对主流库支持更全面；cx_Freeze可能需手动处理某些复杂依赖，但配置灵活性使其能适配特殊场景。

根据项目需求选择工具：追求开发效率选PyInstaller，需要跨平台或精细控制选cx_Freeze。两者均能有效将Python脚本转化为用户友好的可执行文件，提升程序分发便捷性。