根据最新政策规定，父母是低保户而子女户口不在一起时，处理方式如下：

一、申请资格与独立申请

1. 独立申请原则

   子女若与父母户口不在一起，需 单独向户籍所在地申请低保 ，不能与父母共同申请。申请时需满足当地低保标准（人均收入低于标准）及财产规定。

2. 共同生活情形例外

   若子女与父母虽户口分离，但 实际共同生活且收入低于标准 ，可 共同申请低保 。需提供共同生活的证明材料（如居住证明、收入流水等）。

二、财产与收入审核

1. 财产关联影响

   审核时，低保局会核查家庭成员的 存款、收入等财产状况 。即使子女与父母户口不同，若存在赡养关系或经济依赖，其财产可能被纳入审核范围。

2. 存单等材料可查

   纸质存单等直接关联家庭财产的凭证，可能被审计局查询以核实低保资格。

三、申请材料与流程

1. 必备材料

   需提供 身份证、户口簿、收入证明 等。若子女无收入，需额外说明情况。

2. 审核流程

   提交申请后，民政部门会进行入户调查、邻里访问等核实，确保信息真实。

四、注意事项

• 信息真实性 ：申请时需如实填写子女信息，避免因隐瞒影响审核结果。

• 特殊情况说明 ：如子女为重度残疾人或重病患者，可在申请时一并提出，争取适当照顾。

总结 ：户口分离不影响子女独立申请低保，但需单独办理且配合财产核查。若与父母共同生活且符合条件，可联合申请。