毕业论文题目与系统不一致的处理方式需根据学校流程和导师意见综合判断，具体如下：

1. 及时沟通与申请修改

   若题目与系统录入存在差异，应第一时间联系导师或学校管理员说明情况，申请修改。部分学校要求提交书面申请并审批后方可调整。

2. 查重系统对题目的影响有限

   根据查重规则，题目通常不纳入重复率检测（除非学校特别要求）。若题目与系统题目仅存在细微差异（如字词顺序），一般不会触发抄袭判定。

3. 答辩中的处理建议

   若已通过导师同意修改题目，可在答辩记录中注明修改建议，确保流程合规。若未修改，需确保论文内容与题目高度契合，避免因结构混乱被质疑。

4. 避免自行修改未获批准的题目

   未经导师或学校审批擅自更改题目，可能导致延期毕业或论文质量受影响。建议严格遵循流程，确保题目与研究内容一致。

总结 ：题目不一致问题需以导师和学校规定为准，优先通过沟通解决。若涉及查重或答辩流程，建议提前与相关部门确认要求，避免影响毕业进程。