​​农村合作医疗（新农合）和社保医疗的报销比例因地区、医院级别及费用类型存在差异，但社保医疗（尤其是城镇职工医保）总体报销比例通常更高，新农合则对连续参保人员有额外激励政策，且起付线更低。​​

农村合作医疗（现已整合为城乡居民医保）的报销比例一般在50%-70%之间，具体而言：门诊报销中，普通门诊乡镇级可达70%，而村卫生室年度封顶线为缴费金额的60%；住院报销中，一级医疗机构普遍达90%，二级为80%，三级为60%，连续参保3年以上大病报销比例最高提升至85%。大病保险方面，起付线以上部分按60%-80%比例赔付，最高限额可达55万元（因地区政策有所调整）。新农合针对高血压、糖尿病等慢特病实行不设起付线的70%比例报销（乙类自付10%后计算），村卫生室普通门诊报销60%且单次限额10元。

社保中的职工医保覆盖人群为有正式工作者，其报销比例显著更高：门诊统筹部分通常达70%-90%，住院费用报销比例三级医院可达85%-90%，且设有个人账户用于药店购药等日常支出。居民医保（含新农合整合后）报销比例逐年优化，目前住院费用可稳定在60%-75%区间，但需注意异地就医可能存在比例下调情况（最低约30%-40%）。值得注意的是，两地均通过阶梯式激励机制提升参保积极性，如新农合连续参保超5年门诊报销比例可提高3%，而社保长期缴费至退休即可终身免缴享受待遇。

总结而言，社保医疗报销力度占优但缴费成本较高，覆盖全生命周期；新农合起付门槛低且动态激励，适合农村居民灵活参保，需根据就业状态、就诊频率及长期健康规划选择。异地就医务必提前备案，两类医保不可叠加赔付，优先按比例高者申领补偿。