公司零申报可以自行申报，但需确保申报真实合法。以下是具体操作指南及注意事项：

一、申报可行性

1. 操作主体

   纳税人或扣缴义务人（如企业）均可自行完成零申报，无需委托他人。

2. 申报条件

   • 增值税 ：一般纳税人需无销项税额且无进项税额；小规模纳税人需销售额未达免税标准。

   • 企业所得税 ：需确认无经营收入及成本。

   • 个人所得税 ：自然人需通过官方扣缴端完成申报。

二、申报流程

1. 登录平台

   通过国家税务总局网上办税服务厅或电子税务局进入申报入口。

2. 填写申报表

   • 增值税 ：选择“增值税及附加税申报”，填写全部为0。

   • 企业所得税 ：进入“企业所得税申报”，填写月度或季度报表（需注意从业人员不能为0）。

   • 个人所得税 ：通过自然人税务局（扣缴端）完成综合所得申报。

   • 财务报表 ：小企业会计准则下，季度或年度报表均需填写0。

3. 提交与查询

   • 提交后需等待系统更新（如个人所得税需1小时），通过“待办事项”或“申报结果”查看是否成功。

   • 注意：长期零申报可能影响发票使用限额。

三、注意事项

1. 真实性要求

   必须如实申报，避免虚报或瞒报，否则可能面临罚款或信用扣分。

2. 特殊情况处理

   若因系统限制无法全零申报，可向税务机关咨询具体要求，部分情况需线下办理。

3. 风险提示

   连续3个月或累计6个月零申报且无正当理由，可能影响企业信用评级。

四、法律依据

依据《中华人民共和国税收征收管理法》第二十五条，纳税人需按规定期限如实申报，零申报属于合法操作。

总结 ：公司零申报可通过电子税务局自主完成，但需严格遵循申报规则，确保数据真实。建议定期关注税务系统更新，避免因操作失误影响企业信用。