公司缴纳的医保资金主要进入医保统筹账户，用于社会共济保障。具体流向如下：

1. 资金归属与用途

   • 单位缴纳的医保费（约工资的6%-10%）中，约70%（如月薪1万时约560元）直接划入医保统筹账户，用于支付住院、手术、急诊等医疗费用及大病门诊报销。

   • 剩余30%（如240元）划入个人账户，用于门诊挂号、药店购药及住院自付部分。

2. 政策调整与改革

   • 自2021年起，全国实施门诊共济改革，单位缴费全部纳入统筹账户，个人账户仅保留个人缴费部分（约工资的2%）。

3. 资金管理方式

   • 统筹账户由社保中心统一管理，实行专款专用，确保资金安全。个人账户资金可通过医保卡直接使用。

4. 查询与补办

   • 单位缴费记录可通过工资条或社保中心查询，医保卡需本人携带身份证在就近社保中心办理。

总结 ：单位缴纳的医保资金通过改革后全部进入统筹账户，个人账户仅保留个人缴费部分，共同构成医保保障体系。