倪海厦被中医界排斥的原因主要有以下几点：

1. 中医理论和实践的差异：

   • 倪海厦坚持以经方为本，不接受温病学说、时病学说等后世中医流派。
   • 他认为温病派过于谨小慎微，不敢用大剂量的附子、大黄等药物，而他却敢于用大剂量的石膏、黄芩等药物，甚至用西药的剂量来开中药。
   • 他认为时病派过于顺应西医，不敢用中医的辨证论治，而他却敢于用中医的辨证论治来治疗现代疾病，如艾滋病、癌症等。

2. 与现代医学的冲突：

   • 倪海厦对现代医学持有很多的怀疑和反对，他认为现代医学是一种阴谋，是为了控制人类的健康和思想。
   • 他反对疫苗接种，认为疫苗是一种毒物，会导致很多疾病。他反对西药使用，认为西药是一种毒药，会导致很多副作用。

3. 医案记载较少：

   • 在中医界，医案的记载是重要依据之一。倪海厦的医案美中不足的地方在于，他的处方记载较少，开的药方成分不明。

4. 行事风格难以接受：

   • 倪海厦强烈的个性和行事风格是他未被官方认可的重要原因。他在课堂上经常痛骂西药厂和教条主义，直言不讳，这种敢怒敢言的风格在官方看来难以接受。

5. 利益集团的反对：

   • 倪海厦口中的真相是切断西药厂财路的一把利刃，这可不是什么小事。利益集团会放任不管吗?他们会尽可能少地让真相被人知道，而不是像倪海厦那样公开揭露。

6. 文化背景和身份：

   • 倪海厦是台湾人，早年间曾在美国开医馆行医治病多年，后来才回国传播中医。那时候了解倪海厦的人还是比较少的。也就是说，天时、地利、人和，倪师一样都没占到，所以不管是官方也好，还是科班中医也好，对他的了解度和认可度都不是很高。

这些原因共同导致了倪海厦在中医主流圈内难以得到认同和尊敬，甚至遭到排斥和质疑。他在民间却拥有极高的知名度和声誉，这主要得益于他的医术高超、教学服务突出、理论创造力和思维深度等因素。