根据最新权威信息，新疆共有21所本科院校，以下为其中12所较知名高校的名单（按综合排名前五）：

1. 新疆大学

   • 公办综合类大学，学科门类齐全，科研水平高，设有26个学院和95个本科专业。

2. 石河子大学

   • 国家“211工程”“双一流”建设高校，中西部高校基础能力建设工程入选高校，以农业、医学等学科见长。

3. 新疆医科大学

   • 公立医学类高校，前身为1954年成立的新疆医学院，现下设基础医学院、中医学院等25个院部。

4. 新疆师范大学

   • 公办师范类高校，教育学、文学、历史学等学科优势突出，与当地中小学合作紧密。

5. 喀什大学

   • 公办综合性大学，地理位置优越，学科覆盖广泛，是丝绸之路沿线国家农业院校联盟发起成员。

其他说明 ：

• 公办院校占比约90%，民办院校较少（如新疆财经大学、新疆艺术学院等）。

• 部分高校如塔里木大学、伊犁师范大学等因学科特色或地理位置未被列入前五，但均为重点本科院校。

建议通过教育部官网或高校官网获取最新排名信息。