​​新疆的本科大学中，2所属于“211工程”院校，分别是新疆大学和石河子大学，且均为公办综合性大学，其他大部分高校为普通本科公办院校，涵盖师范、农业、医学、财经、艺术等多元化领域，提供丰富的学科选择。​​

新疆大学成立于1924年，是新疆首屈一指的高校，也是国家“211工程”重点建设高校，学科门类齐全，学术实力突出。石河子大学同样作为“211工程”院校，1949年建校，以农学和医学为优势学科，综合实力强劲。新疆农业大学成立于1952年，是一所以农业科学为特色的综合性大学，农学、林学、草业科学等领域学科优势显著。新疆医科大学创建于1956年，专注于医学教育，临床医学、预防医学等专业具有较强的教学和科研能力。新疆师范大学的前身可追溯到1978年，是新疆教师教育的核心基地，以师范教育为主，覆盖文、理、艺术等多学科。喀什大学建立于1962年，位于喀什地区，以培养服务边疆地区发展的应用型人才为使命，师范和语言类专业突出。伊犁师范大学于1948年建校，是新疆历史最悠久的师范院校之一，以教师教育、民族教育见长。新疆财经大学起源于1950年，财经、管理类专业为优势学科，培养经济与管理领域的复合型人才。新疆艺术学院1958年成立，是全国六所综合性高等艺术院校之一，音乐、美术、设计等艺术学科专业优势明显。昌吉学院创办于1959年，以教师教育和工科教育为主，逐步发展为综合型本科院校。塔里木大学成立于1958年，虽然是一所地处南疆的院校，但涵盖农学、理工、师范等多个学科，是一所综合型大学。新疆工程学院成立于1958年，以能源和工程技术为特色，培养工科类应用型人才。新疆警察学院成立于1950年，专注于公安政法类人才的培养，公安学、网络安全等专业实力突出。新疆理工学院虽于2002年才创立，但在理工科领域迅速崭露头角。新疆科技学院2002年成立，以培养经济类应用型人才为基础，逐步拓展多学科领域。新疆政法学院结合法律与政法领域特色，为新疆的法治建设输送人才。中国石油大学（北京）克拉玛依校区作为一所在克拉玛依办学的“211工程”分校，以能源学科为特色，强化实践与创新培养。