新疆公办大学中排名领先的包括​​新疆大学（全国第175名，211、双一流高校，王牌专业涵盖马克思主义理论、数学、计算机科学与技术等）​​、​​石河子大学（全国第231名，211、双一流高校，以化学工程与技术、农业工程为特色）​​和​​新疆医科大学（全国第227名，省重点高校，药学、临床医学专业优势明显）​​，其他如新疆农业大学、新疆师范大学等也位居全国前列。

新疆共有18所公办本科院校上榜，其中新疆大学位列第一，综合实力最强，作为新疆唯一的“双一流”建设高校（A类），其化学和计算机科学与技术学科入选第二轮双一流建设名单，拥有丰富的国家级一流本科专业和特色专业；石河子大学位列第二，是教育部与新疆维吾尔自治区共建的全国重点大学，以医学和农学学科见长，7个学科进入ESI全球前1%；新疆医科大学凭借其深厚的医学教育底蕴，在药学、临床医学等学科领域表现突出，多个专业获评国家级一流本科专业。新疆农业大学、新疆师范大学、塔里木大学等院校在区域特色学科建设中占据重要地位，例如新疆农业大学的草学、水利工程，新疆师范大学的马克思主义理论、美术学，塔里木大学的园艺学等，均展现出较强的学科竞争力。专科学校中，新疆轻工职业技术学院、新疆石河子职业技术学院等在高职教育领域表现突出，其中新疆轻工职业技术学院位居全国第32名。

整体而言，新疆公办高校依托区域特色与政策支持，在学科建设、人才培养等方面稳步发展，其中新疆大学、石河子大学等头部院校竞争力显著，其他院校依托特色学科与区域定位形成差异化优势。考生可结合自身专业兴趣与院校综合实力进行报考选择，同时关注南疆高校如喀什大学、伊犁师范大学在人才培养与社会服务方面的区域贡献，合理规划求学路径。